MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH1

Total Repeats: 3415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020894	GTG	2	6	588	593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987155
2	NC_020894	ACCC	2	8	607	614	25 %	0 %	0 %	75 %	474987155
3	NC_020894	G	6	6	615	620	0 %	0 %	100 %	0 %	474987155
4	NC_020894	ACGC	2	8	641	648	25 %	0 %	25 %	50 %	474987155
5	NC_020894	CGC	2	6	656	661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987155
6	NC_020894	CG	3	6	698	703	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
7	NC_020894	CG	3	6	713	718	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
8	NC_020894	CTG	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987155
9	NC_020894	CGG	2	6	789	794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
10	NC_020894	CAC	2	6	851	856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474987155
11	NC_020894	TCG	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987155
12	NC_020894	CGG	2	6	922	927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
13	NC_020894	GCG	2	6	1035	1040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
14	NC_020894	GT	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	474987155
15	NC_020894	AGC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987155
16	NC_020894	TGG	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987155
17	NC_020894	AGCTCA	2	12	1183	1194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474987155
18	NC_020894	CGG	2	6	1206	1211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
19	NC_020894	GGT	2	6	1232	1237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987155
20	NC_020894	GT	3	6	1236	1241	0 %	50 %	50 %	0 %	474987155
21	NC_020894	CGC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987155
22	NC_020894	GCG	2	6	1370	1375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
23	NC_020894	CGGAGG	2	12	1402	1413	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	474987155
24	NC_020894	TGG	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987155
25	NC_020894	GAG	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474987155
26	NC_020894	CGG	2	6	1480	1485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
27	NC_020894	GGT	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987155
28	NC_020894	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474987155
29	NC_020894	TGG	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987155
30	NC_020894	ACG	2	6	1864	1869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987155
31	NC_020894	GCAGC	2	10	1901	1910	20 %	0 %	40 %	40 %	474987155
32	NC_020894	CGC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987155
33	NC_020894	CGA	3	9	1925	1933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987155
34	NC_020894	CGAGGA	2	12	2003	2014	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	474987155
35	NC_020894	GCG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
36	NC_020894	CGC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987155
37	NC_020894	TGG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987155
38	NC_020894	GATC	2	8	2159	2166	25 %	25 %	25 %	25 %	474987155
39	NC_020894	GGC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
40	NC_020894	CGG	2	6	2197	2202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
41	NC_020894	GGC	2	6	2212	2217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
42	NC_020894	CGG	3	9	2225	2233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
43	NC_020894	CGGC	2	8	2278	2285	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
44	NC_020894	CGC	2	6	2322	2327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987155
45	NC_020894	TAC	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474987155
46	NC_020894	AGC	2	6	2365	2370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987155
47	NC_020894	CAC	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474987155
48	NC_020894	GGA	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474987155
49	NC_020894	GCC	2	6	2445	2450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987155
50	NC_020894	TCC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987155
51	NC_020894	GGC	2	6	2493	2498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
52	NC_020894	GC	3	6	2528	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
53	NC_020894	GC	3	6	2567	2572	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
54	NC_020894	AG	3	6	2612	2617	50 %	0 %	50 %	0 %	474987155
55	NC_020894	GGC	2	6	2624	2629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
56	NC_020894	GCT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987155
57	NC_020894	TCACCC	2	12	2692	2703	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	474987155
58	NC_020894	CCGGG	2	10	2714	2723	0 %	0 %	60 %	40 %	474987155
59	NC_020894	TCG	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987155
60	NC_020894	GCC	2	6	2784	2789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987155
61	NC_020894	GGGAC	2	10	2801	2810	20 %	0 %	60 %	20 %	474987155
62	NC_020894	GCA	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987155
63	NC_020894	CTC	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987155
64	NC_020894	GCA	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987155
65	NC_020894	CGC	2	6	2864	2869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987155
66	NC_020894	CGGC	2	8	2880	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
67	NC_020894	CAC	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474987155
68	NC_020894	GC	3	6	2924	2929	0 %	0 %	50 %	50 %	474987155
69	NC_020894	CCCG	2	8	2967	2974	0 %	0 %	25 %	75 %	474987155
70	NC_020894	ACA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474987155
71	NC_020894	CGG	3	9	3048	3056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987155
72	NC_020894	ACG	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987155
73	NC_020894	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987156
74	NC_020894	CGGGC	2	10	3425	3434	0 %	0 %	60 %	40 %	474987156
75	NC_020894	GC	4	8	3433	3440	0 %	0 %	50 %	50 %	474987156
76	NC_020894	GGT	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987156
77	NC_020894	ACC	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474987156
78	NC_020894	GCC	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987156
79	NC_020894	TGG	3	9	3489	3497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987156
80	NC_020894	TGCC	2	8	3508	3515	0 %	25 %	25 %	50 %	474987156
81	NC_020894	GTG	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987156
82	NC_020894	GCG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987156
83	NC_020894	CAG	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987156
84	NC_020894	GC	3	6	3778	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	474987157
85	NC_020894	AGC	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987157
86	NC_020894	GGC	3	9	3849	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987157
87	NC_020894	GGT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987157
88	NC_020894	GCG	2	6	3887	3892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987157
89	NC_020894	GCG	2	6	3896	3901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987157
90	NC_020894	GGC	2	6	3916	3921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987157
91	NC_020894	GTC	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987157
92	NC_020894	CAC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474987158
93	NC_020894	GGT	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987158
94	NC_020894	CGGG	2	8	4149	4156	0 %	0 %	75 %	25 %	474987158
95	NC_020894	GT	3	6	4239	4244	0 %	50 %	50 %	0 %	474987159
96	NC_020894	CCG	2	6	4260	4265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987159
97	NC_020894	CGAG	2	8	4277	4284	25 %	0 %	50 %	25 %	474987159
98	NC_020894	CGA	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987159
99	NC_020894	ACG	2	6	4311	4316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987159
100	NC_020894	GCC	2	6	4325	4330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987159
101	NC_020894	GCC	2	6	4352	4357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987159
102	NC_020894	CCT	3	9	4401	4409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987159
103	NC_020894	GACGCC	2	12	4442	4453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	474987159
104	NC_020894	CCG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987159
105	NC_020894	CGG	2	6	4486	4491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987159
106	NC_020894	CGG	2	6	4494	4499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987159
107	NC_020894	GTG	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474987159
108	NC_020894	CGG	2	6	4574	4579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987159
109	NC_020894	TCG	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987159
110	NC_020894	CTG	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987159
111	NC_020894	GGACG	2	10	4621	4630	20 %	0 %	60 %	20 %	474987159
112	NC_020894	CGC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987159
113	NC_020894	GCC	3	9	4721	4729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987159
114	NC_020894	CGGCT	2	10	4769	4778	0 %	20 %	40 %	40 %	474987159
115	NC_020894	TCGA	2	8	4796	4803	25 %	25 %	25 %	25 %	474987159
116	NC_020894	GCCGG	2	10	4821	4830	0 %	0 %	60 %	40 %	474987159
117	NC_020894	AGC	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987159
118	NC_020894	GC	3	6	4912	4917	0 %	0 %	50 %	50 %	474987159
119	NC_020894	CGG	2	6	5096	5101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987160
120	NC_020894	TCT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474987160
121	NC_020894	CTT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474987160
122	NC_020894	CGC	2	6	5131	5136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987160
123	NC_020894	TCT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474987160
124	NC_020894	GCT	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474987160
125	NC_020894	CGG	2	6	5163	5168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987160
126	NC_020894	TCT	2	6	5169	5174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474987160
127	NC_020894	GGCCG	2	10	5200	5209	0 %	0 %	60 %	40 %	474987160
128	NC_020894	GCCTTC	2	12	5228	5239	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	474987160
129	NC_020894	CCG	3	9	5277	5285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474987160
130	NC_020894	CTC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987160
131	NC_020894	CTC	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474987160
132	NC_020894	AGCGCG	2	12	5417	5428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	474987160
133	NC_020894	TCGG	2	8	5453	5460	0 %	25 %	50 %	25 %	474987160
134	NC_020894	AGC	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987160
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242	NC_020894	GTA	2	6	11187	11192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474987166
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258	NC_020894	CAG	2	6	11660	11665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987168
259	NC_020894	GGC	2	6	11688	11693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987168
260	NC_020894	GCAC	2	8	11741	11748	25 %	0 %	25 %	50 %	474987168
261	NC_020894	GCCA	2	8	11771	11778	25 %	0 %	25 %	50 %	474987168
262	NC_020894	CAG	2	6	11788	11793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987168
263	NC_020894	AGA	2	6	12204	12209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474987169
264	NC_020894	TGACGC	2	12	12228	12239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474987169
265	NC_020894	TGA	2	6	12267	12272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474987169
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267	NC_020894	CGGC	2	8	12396	12403	0 %	0 %	50 %	50 %	474987169
268	NC_020894	GGC	2	6	12490	12495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987169
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389	NC_020894	AAC	3	9	18734	18742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474987176
390	NC_020894	GCG	2	6	18931	18936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474987177
391	NC_020894	AGC	3	9	18986	18994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474987177
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